工廠化水產養殖是在一個小水體中流水式的養殖方法。養殖設備和養殖手段采用了高度的機械化、電氣化以及電腦自動控制技術等裝置。使飼養的水生生物能在最佳的水溫、水質、溶氧、光照、飼料等條件下生長。餌料利用效率高，水產品無污染、無土腥等雜味。單位水體養殖量大，水體利用率高。
提供給水生生物生長所必需的溶氧、溫度、飼料等可以通過各種機械設備和技術設施解決。在高密度養殖中生物體呼吸和排泄物新陳代謝造成了水體的自身污染，必須把這些殘碴、氨態氮、氨化物及時排除，或降到安全濃度以下是工廠化養殖的技術關鍵。普通排放流水式：如利用河道溪流、山泉水庫、潮汐等。這是種水體溫度隨季節和環境因素變化而變化的流水養殖方法溫流水式：如利用地熱水，電熱站排放溫水。這種養殖方法其養殖規模受流量制約。半流水式：為節省水量和能源，每天定時定量排放養殖池的水體，再補充入新鮮水。這種方法目前養鰻業常用。養殖水池中的有害成分含量的變化在換排水前后不穩定，對水質的管理難度較大，放養密度和生長速度仍受一定限止。循環過濾水式：一種溫流水式養殖，但對養殖用水是經過濾，凈化后反復利用一種閉路循環的養殖方式。凈化后水重新注入養殖池時，進行增氧、調溫、調ph值、滅菌和調節鹽度等。是世界水產養殖中最為先進的養殖技術。